El costo total del Programa de Apoyo al Sector Educativo del MERCOSUR, se calcula en € 9.872.281, de los cuales € 6.772.281 serán financiados mediante el PIR con cargo al presupuesto general de la Unión Europea y € 3.100.000 (de los cuales € 450.000 serán aportados en efectivo y € 2.650.000 en especie) serán financiados por los Gobiernos de Argentina, Brasil, Paraguay y Uruguay, países beneficiarios del PASEM.

El PASEM será implementado bajo la metodología de gestión descentralizada directa.